川渝地区主要家蚕实用品种的SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析

【摘要】家蚕是重要的经济动物,在长期不同生态条件下逐渐形成了多种地理品系。传统的家蚕分类方法主要以经济性状和形态性状为依据,但经济性状受环境影响较大,而形态性状在现行品种间差异较小,因而难以准确分辨。微卫星DNA(SSR)是一种由1-6个核苷酸为单位、经过多次串联重复、长度达到几十甚至是几百个核苷酸的序列,广泛分布在真核生物的基因组。现在SSR已经被用于构建分子遗传图谱、种质资源的鉴定、遗传多样性的分析、基因定位和QTL定位克隆以及分子标记的辅助选择等方面。利用SSR标记构建的家蚕种质资源DNA指纹图谱,可为品种性状的选择提供便捷的方法,对于携带隐性基因家蚕新品种选育和具有特殊性状蚕品种创建,可提高人工选择过程中的准确性,缩短新品种选育的周期,并为家蚕的鉴定、遗传评价和开发利用提供科学依据。本研究以14种川渝地区主要的家蚕品种为材料,以聚丙烯酰胺凝胶电泳分析PCR产物,然后银染的方法,对家蚕微卫星多态性进行研究,研究的主要研究结果如下：1.从36对SSR引物中筛选出多态性较好的26对,分别是S1502、S1503、S1504、S1507、S1508、S1509、S1514、S1515、S1516、S0201、S0213、S0214、S0216、S0217、S0218、S0219、S0220、S0222、S0223、S1117、S1405、S0301、S0302、S0303、S0305、S0307。2.利用26对引物扩增14个家蚕品种的基因组DNA,得到341个SSR位点,其中多态性位点327个,多态性比率95.89%,平均每对引物有13.12个条带,平均多态性比率为94.91%,证明SSR多态性相当丰富。3.UPGMA聚类分析表明,14个家蚕品种的遗传相似系数(GS)介于0.49-0.83之间。以遗传相似系数0.6为界限,样品分为两个大类：其中秋白、限2、854B、湘辉、872A、7532、872B聚为一类；871B、871A、秋丰、限1、夏芳、芙蓉、932聚为另一类。这个结果与品种所属品系一致。4.PCA分析结果与UPGMA聚类分析结果一致。5.根据聚类分析结果,筛选出17对核心引物S1502、S1503、S1504、S1508、S1509、S1514、S1515、S1516、S0201、S0213、S0214、S0216、S0217、S0219、S0301、S0302、S0303。通过核心引物扩增的结果可将14个家蚕品种区分开,同时用这17对引物构建了家蚕DNA指纹数字图谱。
【作者】武婧洁；
【导师】朱勇；雷霆；
【作者基本信息】西南大学，生物工程（专业学位），2014，硕士
【关键词】家蚕；SSR标记；遗传多样性；指纹图谱；

【参考文献】
[1]陈晓菊.论发回重审制度[D].苏州大学,法律（专业学位）,2014,硕士.
[2]徐佳音.蓝色经济发展评估：厦门案例研究[D].厦门大学,环境管理,2014,硕士.
[3]刘雅.论蔡元培的美育思想及其现代意义[D].湖北大学,教育学原理,2012,硕士.
[4]于端端.乡土材料建筑营造技术研究[D].北京建筑大学,建筑技术科学,2013,硕士.
[5]孙涛.中厚板高精度厚度控制的研究与应用[D].东北大学　,2009.
[6]肖国春,曾忠,胡志亮,王兆安.基于可控整流的AVQR直流侧电压给定值自调整方法[J].电力系统自动化,2012,04:74-79.
[7]陈一航.提升地方政府环境治理能力面临的挑战及其对策研究[D].湖南师范大学,行政管理,2013,硕士.
[8]罗媛媛.18世纪女性影响下的法国奢侈消费及文化[D].上海大学,专门史,2014,硕士.
[9]商瑞莹.小学科学课程“物质科学”领域概念及教学研究[D].首都师范大学,科学与技术教育,2014,硕士.
[10]庾小美.英汉学习词典词条输入强化的实证研究[D].广东外语外贸大学,外国语言学及应用语言学,2013,硕士.
[11]唐胜利.动态矩阵控制算法的改进及其应用[D].大连理工大学,控制工程,2003,硕士.
[12]邹李航.上市公司资产减值信息传导效应研究[D].西南大学,会计学,2014,硕士.
[13]武登鑫.基于人体运动学原理的慢跑运动鞋设计研究[D].浙江理工大学,设计艺术学,2013,硕士.
[14]张戈.基于FPGA实时语音识别系统的实现[D].哈尔滨理工大学,微电子学与固体电子学,2012,硕士.
[15]郑巍,刘三阳,寇晓丽.动态传感器网络移动代理路由算法[J].控制与决策,2010,07:1035-1039.
[16]季加苗.介孔二氧化硅纳米胶囊和介孔二氧化钛纳米粒子的制备及在生物医学方面的应用[D].东北师范大学,物理化学,2012,硕士.
[17]黄金林.综合材料在当代油画艺术中的形式意味[D].南昌大学,美术学,2012,硕士.
[18]尹本丰,张元明.冻融过程对荒漠区不同微生境下齿肋赤藓渗透调节物含量和抗氧化酶活力的影响[J].植物生态学报,2015,05:517-529.
[19]郭彦涛.物联网在城轨交通安全应急领域的应用研究[D].北京交通大学,2011.
[20]谢中华.武钢可持续发展目标下的人力资源开发与管理[D].武汉理工大学,交通运输工程,2003,硕士.
[21]赵福霞.中国学生英语幽默理解实证研究[D].西北师范大学,外国语言学及应用语言学,2013,硕士.
[22]郑博恩.股份公司董事会秘书制度研究[D].清华大学,民商法学,2003,硕士.
[23]申佳佳.钢铁表面预处理的研究[D].北京化工大学,材料科学与工程,2013,硕士.
[24]张卫丰,丁艺明.结构化挖掘语言SML的设计与实现[J].小型微型计算机系统,2001,02:195-198.
[25]刘秀娟.高职院校教师专业素质及其发展策略研究[D].河北师范大学,教育管理,2013,硕士.
[26]李宁.沈阳市冰雪运动休闲服务圈现状与发展战略研究[D].沈阳师范大学,体育人文社会学,2013,硕士.
[27]庞鹏飞.基于多特征的图像检索研究[D].西安建筑科技大学,信号与信息处理,2013,硕士.
[28]李俊杰.结晶相分离法制备有序结构多孔材料的研究[D].华东理工大学,材料科学与工程,2014,硕士.
[29]李芸.HIF-1α信号通路与糖尿病脑微血管病变的相关性及干预研究[D].川北医学院,神经病学,2013,硕士.
[30]EMRAHALTINDAL（扬帆）.21世纪中土关系的发展演变及其特点[D].西北大学,国际政治,2014,硕士.
[31]毛燕妮,刘淑娟,廖桢葳,马建国.氨基-β-环糊精-石墨烯-二茂铁修饰电极对多巴胺的电化学行为研究[J].功能材料,2012,08:976-979.
[32]马文斌.网络蠕虫特征码自动提取研究[D].哈尔滨工业大学,计算机科学与技术,2013,硕士.
[33]沈自励,张邦柱,张旻.从卫星遥感中寻找苏州新生构造体系[J].地震学刊.1994(04)
[34]苏雪婷.现代人力资源理论视野下的高校辅导员队伍建设研究[D].内蒙古科技大学,思想政治教育,2013,硕士.
[35]刘瑞冬.水分胁迫下甜菜碱对仁用杏生理效应的影响[D].内蒙古农业大学,果树学,2004,硕士.
[36]陈丽.聚乙烯醇复合膜材料的制备和性能研究[D].合肥工业大学,高分子化学与物理,2013,硕士.
[37]虎德钰.苜蓿后茬不同草田轮作方式对土壤水分和养分的影响[D].宁夏大学,作物（专业学位）,2014,硕士.
[38]苗杰.“对”字句语义句法特点考察[D].杭州师范大学,汉语言文字学,2005,硕士.
[39]韩贝.带整流回路无轴承电机悬浮系统控制策略研究[D].沈阳工业大学,控制理论与控制工程,2013,硕士.
[40]罗羽钊.斯特林整机数值模拟及回热器特性研究[D].华中科技大学,能源与动力工程,2013,硕士.
[41]朱坤.刑事被害人诉讼权利制度完善研究[D].华中师范大学,诉讼法学,2013,硕士.
[42]赵嫭娴.非晶碲镉汞半导体材料的第一性原理研究[D].中国科学院研究生院（上海技术物理研究所）,2014.
[43]刘琦.供应链关系稳定性因素对其绩效的影响研究[D].宁波大学,企业管理,2014,硕士.
[44]李正宏.航运运价指数技术分析研究与应用平台实现[D].上海海事大学,2003.
[45]屈秋瑶.共掺杂纳米TiO_2的制备及光催化降解NO_2~-的效能[D].黑龙江大学,分析化学,2013,硕士.
[46]宋姗.纤维支气管镜下白蛋白泡沫定位气胸肺破裂相关支气管[D].河北医科大学,内科学（专业学位）,2014,硕士.
[47]朱明琴.基于ASP.NET的高职毕业设计信息管理系统设计与实现[D].电子科技大学,软件工程（专业学位）,2012,硕士.
[48]朱益熙.在华韩资企业人力资源管理的问题与解决方案[D].华东师范大学,企业管理,2013,硕士.
[49]黄志斌.广播电视中心技术工艺的设计和实践[J].广播与电视技术.2003(12)
[50]周正权.基于DSP平台的电动机保护装置的设计与实现[D].华北电力大学（北京）,电力系统及其自动化,2003,硕士.